To może być jeszcze inny problem.
W obiegu w większości przypadków są używki. Możliwe, że w docelowym układzie piny JTAG Altery były wykorzystywane jak zwykłe piny I/O. Jest to możliwe przez zablokowanie JTAG-a podczas programowania i wtedy żaden programator za kilka $ takiego układu nie ruszy, tylko jakaś kobyła pokroju Altera Programming Unit.